据Engadget报道，任天堂GameCube的部分稀有版本在二手市场售价已达数千美元，其中《最终幻想：水晶编年史》限定版最近一次成交价为7500美元，成为收藏者追逐的对象。
报道称，这款《最终幻想：水晶编年史》限定版全球仅150台，当年只作为杂志抽奖奖品发放。与常见的珍珠白机型不同，它采用带奶油色调的“水晶白”，并随附Game Boy Player和《最终幻想：水晶编年史》游戏。Game Boy Player是能让GameCube在电视上运行Game Boy、Game Boy Color和Game Boy Advance卡带的扩展设备，北美市场只提供过Jet Black配色，其他颜色主要在日本发行，水晶白是其中较罕见的一种。
二手交易记录显示，今年已有两台该限定版以超过5000美元的价格售出，最近一台成交价为7500美元，5月的另一台成交价略低于7000美元。eBay上目前还有一台未装箱、外壳有轻微磨损的同款主机挂牌出售，标价3750美元。相关数量和价格信息来自eBay卖家及Consolevariations的整理。
其他稀有GameCube机型同样价格不菲。报道提到，喜力GameCube在eBay上的标价最高可达15500美元。2002年，这家荷兰啤酒商在其网站举办抽奖，限定100台，其中50台为Indigo、50台为Jet Black，参与者须年满21岁。日本限定的高达夏亚版则以红色主机和手柄为特征，同样搭配Game Boy Player，稀有度和二手价格低于水晶编年史版。
2003年，任天堂还推出过《仙乐传说》薄荷绿套装，内含GameCube、Game Boy Player和游戏，仅在日本和法国发行，数量约1万台，二手价格最高不超过1500美元，更容易被新收藏者接受。Consolevariations还指出，最稀有的非官方GameCube包括两台喷绘电影联动主机，分别以《极地特快》和《超人总动员》为主题，最初计划用于抽奖。报道最后称，即使普通型号的旧主机，如果不再使用，也可能在二手市场换得现金。